不发芽种谷不发芽的主要原因分析：
①种谷吸水时间短、吸水不足；
②种子数量少，预热温度不够，入堆催芽时的初始温度过低；
③水分偏多，保温效果差，种谷堆中的温度达不到催芽所需要的温度，不能破胸露白。种谷不发芽时应分析原因，区别对待。若人堆初始温度低，种子水分不足，则可用60摄氏度左右温水拌种，增温增湿，再行催芽；因水分过多引起谷堆温度低的，晴天可晒种，增温减湿后重新保温催芽；阴雨天可用少量热水拌种，再加适量干燥蜂窝煤灰减湿增气，重新催芽。催芽时注意加强保温工作。
烧芽种谷破胸后，谷堆温度超过40摄氏度且持续时间较长则易发生烧芽现象，群众俗称“烧桶”。烧芽轻的芽鞘尖上有黄色锈斑或出现畸形芽，烧芽重的芽鞘尖和根尖枯死，并伴有酒味，这是因为谷堆温度过高，透气不良，种谷进行厌氧呼吸，引起酒精积累中毒所致。防止烧芽的关键是注意破胸前后温度的变化，温度过高时及时翻堆散热。
滑亮主要症状是谷壳黏滑起涎，严重时手捏成团，不能自动散开。出现这种情况的原因主要是种子露白前水分过多，不透气，厌氧呼吸旺盛，种子内糖分外溢，加上发酵作用产生有机酸，使微生物在谷壳表面迅速繁殖，造成谷壳发黏，产生酸味和酒气，俗称“滑壳”。催芽温度低、露白的时间过长，以及生活力差的种子最易出现滑壳现象。精选种子，控制露白前的水分和保持足够的温度（一般35摄氏度左右），是防止滑壳的主要方法。
根芽不齐催芽过程中常会出现根芽长短不齐的现象，有时有芽无根或根很短，或根很长而芽很短。产生根芽不齐的主要原因是由于温度和湿度控制不当造成的。谷堆水分不匀，水分多、氧气少的地方由于“湿长芽”则出现芽长根短的现象；水分少、氧气多的地方由于“干长根”则出现根长芽短的现象。谷堆温度不匀，一般谷堆中心温度高、氧气少，则出现“热长根”的现象，幼根生长快，芽生长慢；谷堆四周及表面温度低、氧气足，幼根生长慢，但芽鞘伸长受温度的影响相对较小，则出现“冷长芽”的现象。因此在破胸前后，应充分协调水分、温度和氧气条件，均匀翻种，防止根芽长短不齐。