据试验，水稻用沼液浸种可比清水浸种增产5%～10%，其增产效果十分明显。沼液浸种之所以可使水稻增产，主要是稻种经沼液浸种后，大大地激活了种子的新陈代谢，促进了种子的萌动，提高了种子的内在优势，表现在种子播后，秧苗粗壮，根系发达；移栽后返青快，成活率高，生长旺盛，为丰产奠定良好基础。此外沼液在沼气池中经过厌氧发酵后，具有杀灭病原菌的能力，所以经过沼液浸种的水稻，其抗病能力较强，植株生长健壮，极少发生死苗烂秧现象。
据科研部门化验分析，沼液不但含有多种氨基酸、维生素、蛋白质、酶、矿物质，以及生长素、赤霉素等对作物生长代谢有调节作用的水溶性养分，而且这些营养成分大多还以速效养分的形式存在。这也是水稻沼液浸种增产效果明显的一个原因。
沼液浸种的技术很简单：从正常发酵的沼气池水压箱中层提取适量沼液，放入缸或桶中，然后将稻种浸入缸或桶内沼液中，浸泡3～4天（以断开种子不见米心为宜），然后用清水把稻种冲洗干净，即可催芽播种。