1、粒形鉴别法：普通玉米杂交种，籽粒类型可分为马齿型、半马齿型和硬粒型三种。从外形来分，有长木楔、木楔、短木楔、近圆、圆肾形。如果自交系或杂交系种中混入了异品种种子，则可以根据籽粒的类型而鉴别。

　　2、粒色鉴别法：玉米种子的颜色通常有红、黄、白、紫等，购买时看种子有无光泽主要是用来判断种子的新陈。色泽鲜亮是新收获的种子，色泽较暗的种子可能是隔年陈种。

　　3、玉米质量鉴别法：杂交玉米种由于具有胚胎杂种优势，在一定的区域内相同的土壤和栽培管理条件下繁育的种子、杂交种比母本自交系种子粒重高。

　　4、发芽势法：一般杂交种粒大、饱满、整齐、生活力强，因而发芽势较母本自交系强。

　　5、种植鉴别法：种植鉴别是最准确可靠的方法。它既适用于区分自交系与自交系，又适于坚定纯度。有三种方式：翌年种植；冬季就地温室种植；冬季海南岛异地种植。