棉花枯、黄萎病的防治应采取以种植抗病品种为主的综合防治策略。防治措施如下。

　　（1）种植抗病品种我国目前推广的品种大多数为抗枯萎耐黄萎病品种。近年，通过国家审定的双抗品种有中植棉2号、邯5158、冀杂1号，抗枯萎耐黄萎品种有中41、中49、中51、鲁棉研28、鲁棉研29、冀棉958、邯棉802等。

　　（2）实行轮作倒茬与小麦、玉米、水稻等作物轮作，尤以水旱轮作最好。如：与水稻轮作1年以上，再种3年棉花，或与玉米、小麦轮作2年，再种棉花。

　　（3）加强棉田管理清洁棉田，及时清沟排水，降低棉田湿度，使其不利病菌孳生和侵染；增施有机肥，重施底肥，后期增施钾肥,增强棉株抗病力。

　　（4）化学预防出现零星病株，可用50%棉隆可湿性粉剂对水浇灌渗透；5月下旬，每7～10天喷施叶面抗病诱导剂，如威棉1号、99植保、活力素等300～500倍液，连续4次；8月中旬以后，继续喷施2～3遍；9月10日左右，与叶面肥如磷酸二氢钾等一同施用。