夏玉米苗枯病引起苗枯的病原主要是串珠镰刀菌。地势低洼，土壤贫瘠，黏土地、盐碱地发病重，播种过深也易发病。土壤积水的田块，苗期会形成芽涝现象，幼苗不能正常生长发育，使根系发育不良引发苗枯病。小麦、玉米是全国的主要轮作方式，近几年小麦根病发生严重，导致串珠镰刀菌、禾谷镰刀菌和玉米丝禾菌等病原菌积累，也加重了苗枯病的发生程度。