北仑区境夏、商时代属“东夷”地，少康时号于越，至春秋战国时期为越国地。

战国中期，楚占越地至浙江（今钱塘江），浙江以南的越族仍由其“君长”管辖。

自公元前222年秦置会稽郡，下辖句章、鄞、鄮三县，该区境属鄮县（东境）。

自秦历汉、三国吴、晋、宋、齐、梁、陈均为鄮县东境。

隋文帝开皇九年（589），隋灭陈，并鄞、鄮、余姚三县入句章县，遂为句章县东境，属吴州辖。

唐高祖武德四年（621），析句章县，置姚州，鄞州，该地属鄞州。

武德八年鄞州废，更鄞州为鄮县，属鄮县东境。

唐宪宗元和四年（809）在鄮东甬江口建望海镇。

五代后梁太祖开平三年（909），改鄮县为鄞县；置望海镇为望海县，未几，改名定海县。

北仑区境之大部分为鄞县地，属吴越国明州望海军；惟崇邱乡（今小港地区）时属定海县。

宋太祖建隆元年（960），改望海军为奉国军，北仑区境之大部分隶属两浙路明州奉国军鄞县。

宋神宗熙宁十年（1077）划鄞县东境之灵岩、泰邱、海晏三乡归定海县，和原属定海县之崇邱乡一起，该区全境始属定海县。

元、明时建置袭宋。

清康熙二十六年（1687），定海县更名为镇海县（次年在舟山昌国另建定海县），

历清、中华民国时期，建国后直至1985年镇海撤县止（其中1958年11月—1962年镇海县一度撤销，归宁波市；1984年划部分地建滨海区），该区境均属镇海县。

1985年7月，镇海县撤县划区，以甬江为界，南为滨海区，北为镇海区。

1987年7月滨海区更名为北仑区。