先秦时期，那思镇属百越之地，秦始皇统一中国后，那思镇归属象郡所辖。汉朝至晋朝，属交州合浦郡，南朝末元嘉设末寿郡，梁代设安州。

唐武德五年（公元622年）改宁越郡为钦州总管府，元属钦州路，明履属钦州府。

清光绪十四年 (1888年) 拨人钦州直隶州，民国19年置那思乡，1930年分为那思、安农2乡。

中华人民共和国成立后，1950年仍分为那思、安农2乡，1951年春分为9个小乡，1957年合并为那思乡，1958年秋并入三那大公社，1959年6月分设那思公社，1984年9月改为乡。

1994年6月28日，经国务院批准，撤销钦州地区，设立地级钦州市，钦州市分成钦南区和钦北区，那思镇隶属钦南区。