孟连，秦朝属西南夷地。

西汉为哀牢地；东汉至三国蜀汉属益州永昌郡；两晋南北朝属宁州永昌郡。

隋代属濮部。

唐南诏国称茫天连，属茫部地，隶属永昌节度。

宋大理国称“孟连”，属永昌府。

元至元二十六年（1289年）置木连路；后改属银沙罗甸宣慰司。

明永乐四年（1406年），正式建立土司制度，设孟琏长官司，隶云南都司，辖今孟连、澜沧、西盟等地及南卡江以西、萨尔温江以东的哈瓦地区，长官司驻今孟连。

清顺治十七年（1660年），孟琏长官司改属永昌军民府；康熙四十八年（1709年）改置猛连宣抚司，属迤西道永昌府；乾隆二十九年（1764年）改属迤西道顺宁府；光绪二十年（1894年）改属镇边直隶厅（今澜沧），隶迤南道。

民国二年（1913年）4月，镇边直隶厅改为镇边县；民国3年（1914年）1月，因与贵州省镇边同名，乃以其地滨于澜沧江而易名为澜沧县。

1949年4月5日，孟连县临时人民政府成立；1949年8月后，隶属思普临时人民行政委员会领导；1949年10月，思普临时人民行委会决定撤销澜沧区专员公署；1949年12月，撤销孟连县建制，并入澜沧县，成为澜沧县下辖的一个区，澜沧县临时人民政府在孟连设立办事处；1950年6月，成立了澜沧县人民政府，属宁洱专区；1950年9月，撤销孟连办事处，成立孟连区临时人民政府；1951年3月改称孟连中心区人民政府；1951年4月，将宁洱专区更名为普洱专区，澜沧县属之；1953年3月，普洱专区更名为思茅专区，澜沧县属之；1954年6月，成立孟连傣族拉祜族卡佤族自治区（县级），以澜沧县的孟连区、南卡区为其行政区域，隶属思茅专区；1963年9月，孟连傣族拉祜族佧佤族自治县改名为孟连傣族拉祜族佤族自治县；1970年，思茅专区改为思茅地区，孟连县属思茅地区；2003年10月，撤销思茅地区，设立地级思茅市，孟连县属地级思茅市；2007年，思茅市更名为普洱市，孟连县属地级普洱市。