据考古发现，耀州区有新石器时代遗址多处，城北塔坡一带就是一处典型的仰韶文化遗址，距今已有五、六千年历史。《资治通鉴纲目》中有关于母系氏族领袖“阴康氏治于华原”的记载，其治地大致在今塔坡原上。

夏商时，各地氏族部落先后结成方国，从事农业生产。据《陕西通志·夏商国邑考》记载，时雍州有国邑43个，位于漆沮之间的华原即属其一。

秦置郡县，京畿为内史，区境属内史地。秦亡，项羽立塞国，区境属塞国地。

西汉高祖二年（前205），属河上郡。九年（前198），复归内史。景帝二年（前155），始置祋祤县，属左内史。祋祤因何得名，众说不一，详见《杂志·史料考证》。武帝太初元年（前104），改左内史为左冯翊，县属左冯翊。

王莽新时（9--24年），冯翊改属列尉大夫。不久，县制撤销。

东汉永元九年（97），恢复祋祤县，又撤翟道县（今黄陵县）入祋祤，仍属左冯翊。

曹魏黄初元年（220），将原在今甘肃宁县境内的北地郡及泥阳县侨置于祋祤境内，并撤祋祤并入泥阳县，隶北地郡。西晋因之。

北魏孝庄帝永安元年（528）在原北地郡设北雍州，所辖北地郡（缩小地域）领泥阳县。太平真君七年（446），撤泥阳入富平。景明元年（500），复置泥阳，仍属北雍州之北地郡。

西魏废帝三年正月（554），改北雍州为宜州，改北地郡为通川郡，辖泥阳、富平、土门、云阳四县。

隋开皇三年（583），撤通川郡，泥阳改属宜州。六年（586），改泥阳为华原县。大业二年（606），撤宜州，并撤土门县（今富平境）入华原，改属京兆郡。义宁元年（617）置宜君郡，治华原，并恢复土门县。

唐武德元年（618），又改宜君郡为宜州，治华原。贞观十七年（643）撤宜州，华原改隶雍州。垂拱二年（686），为避武则天祖讳改华原为永安县。天授元年（690），复置宜州于永安。神龙元年（705），恢复华原县。天祐元年（904），凤翔节度使李茂贞于县置茂州，旋改耀州，建义胜军节度，辖华原一县。耀州之名，即始于此。

后梁贞明元年（915），改耀州为崇州，义胜军为静胜军。后唐同光元年（923），复名耀州，并改静胜军为顺义军，辖华原、富平、三原、云阳、同官、美原六县。

北宋开宝五年（972），升耀州为感义军节度，辖华原一县。太平兴国二年（977），又改感德军太守，辖华原、淳化二县。元祐三年（1088），复辖华原、云阳、富平、同官、三原、美原六县。

金仍耀州，辖华原、美原、同官、三原四县。

元仍耀州，隶奉元路，辖华原、富平、三原、同官、美原五县。（惠宗）至元元年（1335），撤华原入耀州，县名为州名所代，辖同官、富平、三原三县。

明清仍为耀州。明万历前，辖同官、富平、三原、宜君四县;万历后只辖同官一县。清雍正三年（1725），升为直隶州，辖同官、白水二县。十三年（1735）降为散州（无辖县），改属西安府。

民国二年（1913），始称耀县，属关中道。十七年（1928）为省辖县。二十六年（1937），改属第七区行政督察专员公署。二十九年（1940），属第十区专员公署。三十三年（1944），第二区专员公署移驻耀县，辖耀县、富平、同官、宜君、淳化、旬邑、彬县六县。三十六年（1947），改为第三区专员公署，辖耀县、富平、同官、宜君、黄陵、三原、泾阳、淳化八县。三十八年（1949）一月，三区专员公署迁驻三原。

1949年4月28日全境解放，属三原军分区。

1950、1953年先后改属咸阳和渭南地区行政专员公署。

1956年为省直辖县。

1958年底，撤县并入铜川市。

1961年8月县制恢复，又属渭南地区专员公署，1980年1月，改属铜川市辖县。

2002年6月18日，国务院批准（国函[2002]54号）：撤销耀县，设立铜川市耀州区，以原耀县的行政区域为耀州区的行政区域，区人民政府驻城关镇。