我国政府十分重视农业转基因生物安全管理工作，已经形成了一整套适合我国国情并与国际惯例相衔接的法律法规、技术规程和管理体系，依法实施安全管理取得显著成效。一是建立健全配套规章，依法实施监督管理。1996年，农业部发布了《农业生物基因工程安全管理实施办法》。2001年，国务院颁布了《农业转基因生物安全管理条例》（以下简称《条例》），对在中国境内从事的农业转基因生物研究、试验、生产、加工、经营和进出口等活动进行全过程安全管理。《条例》颁布实施后，农业部和国家质检总局先后制定了5个配套规章，发布了转基因生物标识目录，建立了研究、试验、生产、加工、经营、进口许可审批和标识管理制度。二是加强技术体系建设，为安全监管提供有力的技术支撑。农业部组建了农业转基因生物安全委员会、全国农业转基因生物安全管理标准化技术委员会，建设了一批环境和食用安全检测机构，其中35个已通过国家计量认证和农业部审查认可。借助转基因生物新品种培育重大科技专项的实施，大力组织开展转基因生物分子特征、环境安全和食用安全性研究，研制检测技术标准，组织安全评价，不断提高技术支撑能力。截止2009年底，农业部已发布了62项转基因生物安全技术标准，保障了依法行政的技术需求。三是科学规范开展安全评价和环境监测，保障转基因生物环境和食用安全。农业转基因生物安全委员会按照条例、安全评价办法和评价指南的要求，遵循科学、个案、熟悉和逐步的原则，参考国际食品法典委员会、联合国粮农组织、世界卫生组织、经济合作组织等制定的转基因生物安全评价指南，科学规范开展农业转基因生物安全评价工作。在安全评价合格的基础上，农业部批准发放了转基因棉花、番茄、矮牵牛、甜椒和番木瓜等植物的生产应用安全证书，以及转基因大豆、玉米、棉花和油菜等进口安全证书。与此同时，组织开展转基因抗虫棉等作物生态环境长期风险监测，保障转基因生物产业健康可持续发展。四是加强行政监督管理，确保各项活动有序进行。《条例》实施以来，各级农业行政管理部门不断健全管理规章，改善管理条件，切实加强田间试验、品种审定、种子生产经营和产品标识等环节的行政执法监管，确保各项活动有序进行。大力开展法规培训和科普宣传，努力提高研发者、经营者和管理者的安全意识和管理水平。