根据《地表水环境质量标准》，集中式生活饮用水地表水源地的水体中，氯化物含量应不超过250 毫克/升。当河道水体含盐度超过这一标准，就不能满足供水水质要求，影响城镇生活用水、工业供水及农业灌溉。
威胁身体健康。海水的氯化物浓度一般高于5000毫克/升，当咸潮发生时，河水中氯化物浓度从每升几毫克上升到超过250毫克。水中的盐度过高，会对人体造成危害，老年人和患高血压、心脏病、糖尿病等人群不宜饮用这类水。
加剧工业生产用水短缺。水中的盐度高还会对企业生产造成威胁，生产设备容易氧化，锅炉容易积垢。在咸潮灾害爆发后，生产中用水量较大且对水质要求严苛的化学原料及化学制品制造、金属制品、纺织服装等产业受到的冲击较大，其中一些企业甚至不得不面临停产。
推高地下水和土壤的盐度，威胁农业生产和植物生存。例如，柑橘和柠檬对氯化物的忍耐度较低，浓度超过几十毫克/升的水就会对其造成危害。而发生在广州的一次咸潮灾害中，尽管当地一些水沟里蓄有少量水，然而它们附近的田地却龟裂着。这是因为，咸潮导致沟里的水咸度过高，而如果农作物“饮用”这样的水，不久就会停止生长，甚至死掉。